深加工通过物理、化学或生物学手段对原料进行加工，如制作果汁、酒类等。其特点是投资规模大、科技含量高、效益显著、能够推动产业化发展、竞争力强、社会效益高。 中级加工 中级加工的加工程度介于初级加工和深加工之间。
农副产品的深加工是通过于对水果蔬菜、花生类、大豆类以及大宗的农产品进行二次加工，使农产品更加具有价值，一般经过深加工的产品，市场价格可以增加2-10倍，进行了加工的农副产品也能保存的更长久，有些农副产品进行加工后营养价值也会相应的进行提升，销路也更为广阔。
农产品初加工是指在不涉及农产品内在成分的改变的一次性的加工，包括对收获的各种农产品进行的清理、分类、包装等步骤的简单的加工处理，以便于给初级市场提供服务。
农产品深加工，指对农业产品进行深度加工制作以体现其效益最大化的生产环节，这一概念与农产品初加工相对应。
该产业优势在于提高附加值、扩大销售市场、延长保质期等方面。提高附加值：通过深加工，农产品可以转化为更高附加值的产品，如食品、饮料、保健品等，从而提高农产品的经济价值。延长保质期：深加工可以有效地延长农产品的保质期，减少因保质期短而导致的浪费。
农产品深加工产业的优势在于：提高农产品质量，增强农产品市场竞争力；保存期长，易于运输；提升农产品附加值和农业效益。农产品深加工是指对农业产品进行深度加工制作以体现其效益最大化的生产环节，“农产品深加工”与“农产品初加工”概念相对应。
农产品深加工是一个具有巨大潜力的领域。农村地区通常拥有丰富的农产品资源，如水果、蔬菜、粮食等。通过深加工，可以将这些农产品转化为附加值更高的产品，如果汁、罐头、干果、腌制品等。这不仅可以延长农产品的保质期，还能提高农产品的市场价值，为农民带来更多的收入。
资源优势。一是农产品资源优势。各地已建成各种特色主导产业基地，基地面积不断扩大，产量不断增加，充足的资源优势是农产品深加工产业发展的有力支撑；二是劳动力资源优势。
水果蔬菜再加工。一些水果、蔬菜不宜保存过久，容易腐烂，将水果蔬菜再加工一下，更加容易储销售，像果脯、蜜饯、干果等加工食品，都是不错的创业项目。甘薯系列产品加工。甘薯深加工可制成400多种副食品，深加工工业产品多达1000种以上，如丁酸、酒精、柠檬酸、赖氨酸、磷酸淀粉酯等。
农产品深加工项目包括： 食品加工：设立豆制品加工厂；创建罐头厂、果脯厂等水果类食品加工厂；建立脱水蔬菜厂、辣椒加工厂等蔬菜类食品加工厂；创办生产淀粉、面包、饼干等面食类加工厂。 木材加工：建立木材加工厂，生产家具等产品。 家禽肉品加工：开设拆卸肉食深加工厂，加工家禽肉品。
水果和蔬菜的深加工项目。一些水果和蔬菜由于易腐性，不宜长时间存放。通过深加工，如制作果脯、蜜饯和干果等，可以延长其保质期，便于储存和销售。这些加工后的食品市场需求稳定，是良好的创业选择。 甘薯深加工产品系列。
挂面加工，手工制作的挂面，口感好、拉力大、深受城乡居民的喜爱。所以，开设挂面加工，运用传统手艺加工，定能畅销。 辣椒加工，辣椒是“健胃剂”。可加工制成泡红椒、红辣椒、辣椒酱、芝麻辣酱、豆瓣辣椒酱、辣椒油、辣椒面等，这些也是人们喜爱的食品。
1、水果蔬菜再加工。一些水果、蔬菜不宜保存过久，容易腐烂，将水果蔬菜再加工一下，更加容易储销售，像果脯、蜜饯、干果等加工食品，都是不错的创业项目。甘薯系列产品加工。甘薯深加工可制成400多种副食品，深加工工业产品多达1000种以上，如丁酸、酒精、柠檬酸、赖氨酸、磷酸淀粉酯等。
2、农业深加工的项目有粮食深加工、肉类深加工、水果深加工、蔬菜深加工、其他农业产品深加工。粮食深加工 粮食是农业的主要产品之一，可以进行深度加工，如小麦深加工、玉米深加工等。小麦可以加工成面粉、面条、饼干等；玉米可以加工成玉米粉、玉米片、甜玉米粒等。
3、食品加工 在农村开小型粮食加工厂，利用大豆可以加工成各种豆制产品；水果产区，可以建一个储运保鲜加工厂、罐头厂、果脯厂、蜜饯厂、果干厂、果酱厂等，蔬菜产区，可以建脱水蔬菜厂、盐水蘑菇厂、辣椒加工厂等。
4、其次，农产品加工业还包括饲料加工行业。这个行业将农产品加工成为各种动物饲料，包括谷物饲料、蛋白饲料、浓缩饲料等，用于畜禽养殖业。另外，农产品加工业还包括纺织原料加工行业。这个行业将农产品如棉花、羊毛等加工成为纺织原料，用于纺织业的生产。
5、谷物深加工领域涉及小麦、稻米、玉米和小杂粮等多个子领域。 薯类也是农产品深加工的一个重要分支。 蔬菜深加工包括蔬菜提取物、保鲜和冷冻蔬菜以及脱水蔬菜等多种形式。 水果深加工则涵盖水果提取物、保鲜水果、冷冻水果和速冻水果等。 坚果和浆果类农产品同样拥有其独特的深加工领域。